Realmente, a expressão deve ser feita dessa forma. Após tentar implementar diversas tratavias, percebi que o problema estava no campo de preço. Por estar formatado como moeda (R$) e dentro de uma tabela, o valor não estava sendo atribúido ao campo e portanto a condição não entrava em nenhum mecanismo. Para resolver o problema, coloquei o campo de preço fora da tabela e atribuí o valor total (R$) a um input do tipo hidden, onde foi feito a conversão de string para inteiro. Ao invés de passar para a condição o campo com formato de moeda (R$), passei o input do tipo hidden, já convertido para inteiro. Dessa forma a condição funcionou normalmente.

Solução Implementada:

• HTML

<label class="control-label" id="R0">Preço Bruto Total(R$)</label>
<input type="text" class="form-control tpr" id="C029" name="C029" readonly/>
<input type="hidden" id="V000" name="V000"/>

• SCRIPT

document.getElementById("C029").textContent = total;
document.getElementById("V000").value = parseInt(total.replace(/\./g,"").replace(",",".").split('.')[0]);

• PROCESSO

A atividade destino está sem o mecanismo de atribuição?

Fiz um teste aqui e consegui executar. Não cheguei a testar usando a expressão avançada.

Como a sua string é formatada acho que terá que converter pra número mesmo. Mas vi que está usando regex e, infelizmente, esse evento ocorre no backend e em Java a replace não aceita regex. Mas aí bastaria usar replaceAll e passar a regex como string.