Imagem do erro: link
Após atualizar a plataforma para o Fluig 1.6, esse erro começou a aparecer ao tentar comunicar com o servidor para exportação de arquivos. Na hora pensei que fosse a versão do plugin, mas mesmo atualizado o problema persiste.
O servidor, no caso, já era um servidor configurado válido.
EDIT 29/03/2017:
Ok, descobri que o emissor do meu certificado requer que instale um certificado intermediário. O site do emissor (link) possui o manual, mas preciso saber qual das tecnologias o Fluig usa para hostear o servidor. Alguém sabe qual que é?