Bom dia Diego, Você pode utilizar o evento .change do jQuery para verificar se o checkbox foi marcado ou não e a partir daí utilizar a função reloadZoomFilterValues() para atualizar os dados que serão apresentados no seu zoom.

$("#chk").change(function () {

    if ($('#chk').is(":checked")) {
        reloadZoomFilterValues("nome_do_campo_de_zoom_que_receberá_o_filtro", "campo_a_ser_filtrado," + selectedItem["valor_que_ira_filtrar"]);
    }else{
        reloadZoomFilterValues("nome_do_campo_de_zoom_que_receberá_o_filtro", "campo_a_ser_filtrado," + selectedItem["valor_que_ira_filtrar"]);
    }

});

Abraço!

Editando:

Esse é meu HTML, o dataset ds_tipoSolicitacao também vem de um formulário.

<div class="col-sm-4">
                          <div class="form-group">
                             <label for="txtTipo">Tipo de Serviço</label>
                             <input
                                 type="zoom"
                                 id = "tipoSolicitacao"
                                 name="tipoSolicitacao"
                                 data-zoom="{
                                 'displayKey':'txtDescricao',
                                 'datasetId':'ds_tipoSolicitacao',
                                 'maximumSelectionLength':'1',
                                 'placeholder':'Escolha o tipo de serviço',
                                 'fields':[
                                 {
                                 'field':'id',
                                 'label':'ID'
                                 },{
                                 'field':'txtDescricao',
                                 'label':'Descrição',
                                 'standard':'true'
                                 }
                                 ]
                                 }"
                                 />
                          </div>
                      </div>

Ele sempre é recarregado baseado na troca do elemento de outro Zoom. Esse é o custom.js

function setSelectedZoomItem(selectedItem) { 

    if (selectedItem.inputId == "departamentoDestino") {
        var groupId = selectedItem.groupId;
        $('#setorDestino').val('Pool:Group:'+groupId);
        window['tipoSolicitacao'].clear();
        reloadZoomFilterValues("tipoSolicitacao", "departamento,"+selectedItem["groupId"]);
    }
}


function removedZoomItem(removedItem) {

    if (removedItem.inputId == "departamentoDestino") {
        window['tipoSolicitacao'].clear();
        window['transferencia'].clear();
    }
}