Até onde me consta, oficialmente não há um mecanismo homologação para customizar isso.

O que você poderia fazer é utilizar o mecanismo descrito aqui: https://tdn.totvs.com/pages/releaseview.action?pageId=232816834, onde você pode inserir um javascript customizado que vai rodar em todas as página, daí tu pode conferir a URL se contém o "/ecmnavigation" e então buscar o elemento select que tem as opções e adicionar a opção nele por exemplo.

Isso levando em conta que você testou, e o fluig já funciona se recebe um valor maior.

Importante notar, que se algo mudar na plataforma seu script pode parar de funcionar.

Seguindo a orientação do Rafael Vanat eu criei a custompagehead.ftl para personalizar as páginas do Fluig e inseri o seguinte código:

<script>
$(function () {
    if (!location.href.includes('/ecmnavigation')) {
        return;
    }

    const options = '<option role="option" value="500">500</option>'
        + '<option role="option" value="1000">1000</option>'
        + '<option role="option" value="1500">1500</option>';

    setTimeout(() => $('select.ui-pg-selbox').append(options), 2000);
});
</script>

Foi necessário colocar o setTimeout para dar tempo do Fluig carregar todo o conteúdo da paginação (pelo que percebi ele carrega os elementos por Ajax ao invés de diretamente no HTML).