Eu crio os slots com um código mais ou menos assim:

Código

<#import "/wcm.ftl" as wcm/>
<@wcm.header authenticated="true"/>
<!-- WCM Wrapper content -->
<div class="wcm-wrapper-content">

    <@wcm.menu />

    <!-- Wrapper -->
    <div class="wcm-all-content">
        <div id="wcm-content" class="clearfix wcm-background">
                 <!-- Onde deverá estar a barra de formatação -->
                <#if pageRender.isEditMode()=true>
                <!-- Div geral -->
                <!-- Há CSS distinto para Edição/Visualização -->
                <div id="edicaoPagina" class="clearfix">
                <#else>
                <div id="visualizacaoPagina" class="clearfix">
                </#if> 

                <div id="all-slots-left" class="editable-slot slotfull layout-2-3left clearfix">
                    <!-- Slot 1 -->
                    <div class="editable-slot slotfull layout-1-1" id="divSlot1">
                           <@wcm.renderSlot decorator="false" id="SlotA" editableSlot="true"/></div>

                    <!-- Slot 2 -->
                     <div class="editable-slot slotfull layout-1-1" id="divSlot2">
                        <@wcm.renderSlot decorator="false" id="SlotB" editableSlot="true"/>
                     </div>
                 </div>

                 <div id="all-slots-right">
                     <!-- Slot 3 -->
                     <div class="editable-slot slotfull layout-1-1" id="divSlot3">
                         <@wcm.renderSlot decorator="false" id="SlotC" editableSlot="true"/>
                     </div>

                     <!-- Slot 4 -->
                     <div class="editable-slot slotfull layout-1-1" id="divSlot4">
                         <@wcm.renderSlot decorator="false" id="SlotD" editableSlot="true"/>
                     </div>
                  </div>

            </div>

        </div>
    </div>
</div>

Durante a edição os slots funcionam corretamente, até mesmo com as widgets, porém na hora de publicar, acontece uma "quebra de layout" com slots descendo, rodapé cortando o meio da tela, etc. Já tentei utilizar os layouts disponíveis no próprio fluig, isso acontece com eles também.